Coordenador: Marcio Luiz de Oliveira
A CPEN caracteriza-se pelo estudo de Entomologia Sistemática, Biogeografia, Entomologia Médica (Genética de Populações de Vetores de Malária e Dengue), Entomologia Agrícola e Bioecologia de insetos, contribuindo assim para ampliar o conhecimento da entomofauna amazônica. Na Coordenação, encontra-se a maior coleção de Zoraptera (insetos pequenos que ocorrem sob troncos de árvores em decomposição) e Mecoptera (mosquito de grande porte, de difícil captura) da Região Neotropical, bem como os tipos de diversas ordens. Possui, ainda, a segunda coleção do Brasil em espécimes de Diptera (moscas e mosquitos em geral).