Coordenador: Maria Mercedes Bittenccurt
A CPBA estuda os ecossistemas aquáticos da Amazônia, buscando conhecer suas características, funções, inter-relações e ciclos de vida dos animais e plantas que neles vivem. A Coordenação busca, também, determinar diversos parâmetros biológicos e ecológicos de organismos aquáticos amazônicos (algas, crustáceos, peixes, quelônios e mamíferos aquáticos), incluindo a descrição de novas espécies e revisões taxonômicas de grupos da fauna e da flora aquáticas. Promove, ainda, o uso adequado do conhecimento adquirido na preservação e exploração sustentada dos recursos naturais da região.