O objetivo das pesquisas desenvolvidas pelo Inpa e o Smithsonian Institution - SI, visa determinar os efeitos da fragmentação florestal sobre a dinâmica; composição florística; estrutura e biomassa da comunidade arbórea da Floresta Amazônica de Terra Firme; compreenção dos efeitos destes fragmentos sobre a biomassa e florística da comunidade de lianas (trepadeira, cipó); descrição dos padrões fotosociológicos da comunidade de árvores e de lianas e correlacioná-las com variáveis ambientais como o solo; estudar os efeitos do El Nino associado à fragmentação e sobre a mortalidade de árvores; os fluxos de carbono e sua relação com o efeito estufa global além da aplicação dos resultados sobre a fragmentação florestal na conservação da Floresta Amazônica.